IgA肾病的确切发病机理尚未完全清楚，多种因素和发病有关。目前比较一致的看法是IgA肾病属免疫复合物引起的肾小球疾病。
1、与免疫系统的关系：IgA肾病主要是以多聚体IgA(PIgA)在肾小球沉积，表明了IgA免疫系统导致了PIgA分子的在循环系统中出现和肾小球系膜区的沉积。
2、与骨髓的关系：肾小球系膜区沉积的IgA1，且存在于血液中IgA-1相似的铰链区糖基化异常，提示IgA肾病患者沉积在肾小球系膜区的IgA为骨髓源性IgA。
3、与细胞因子的关系：IgA肾病患者系膜区沉积的IgA-1引起系膜细胞分泌炎症因子。
原发性IgA肾病会引起的并发症主要有血尿、蛋白尿、肾功能不全和肾衰竭，具体如下：
1、血尿和蛋白尿
血尿和蛋白尿是iga肾病患者症状中最主要的并发症，且通常表现为血尿或蛋白尿，两者同时出现很少见。Iga肾病患者出现肉眼血尿后会伴有全身不适的症状。严重的患者会出现持续性的蛋白尿和血尿。
2、肾功能不全
iga肾病患者患病后会出现严重的血压升高的现象，如果疾病没有得到有效的控制，高血压会导致人体动脉硬化，导致肾功能进一步损伤，最后造成肾功能不全的产生。
3、肾衰竭
除了上述中出现的并发症以外，iga肾病患者还会有肾衰竭的现象。这主要是由于iga肾病没有进行系统性的治疗，导致患者的肾功能逐渐受损，最终恶化为严重的肾衰竭或者尿毒症的产生。
IgA肾病多在上呼吸道感染（或急性胃肠炎、腹膜炎、骨髓炎等），1～3天后出现易反复发作的肉眼血尿，持续数小时至数天后可转为镜下血尿，可伴有腹痛、腰痛、肌肉痛或低热。部分病人在体检时发现尿异常，为无症状性蛋白尿和（或）镜下血尿，少数病人有持续性肉眼血尿和不同程度蛋白尿，可伴有水肿和高血压。大多数无异常体征，部分病人可有双肾区叩击痛、水肿和轻、中度血压升高。根据临床可初步诊断IgA肾病（炎），确诊必须做肾组织免疫病理检查。
防止感冒和过度劳累，慎用肾毒性药物，有感染时应予抗生素治疗适当休息，避免剧烈运动但病情稳定时，注意适当锻炼增加抗病能力，避免受凉，减少感染的机会，一旦出现各种感染，应及时应用强有力的抗生素以及早控制感染有反复发作慢性扁桃体炎者，可性扁桃体摘除
IgA肾病多为轻、中度蛋白尿（
IgA肾病的饮食应以清淡为主，宜多吃水果、蔬菜及优质高蛋白食物，鸡蛋、牛奶、豆制品、蔬菜、水果等可以适当食用，对于患者营养的改善和体质的恢复是有帮助的。禁辛辣、肥甘厚味以及霉制品、腌制食品和酒。
原发性IgA肾病的西医治疗方法主要包括一般治疗、药物治疗和血液净化疗，具体如下：
一、一般治疗
防止感冒和过度劳累，慎用肾毒性药物。有感染时应予抗生素治疗。有反复发作慢性扁桃体炎者，可行扁桃体摘除。
二、药物治疗
1、血尿明显者可用雷公藤多甙、潘生丁、ACEI及大量维生素C口服治疗。
2、呈肾病综合征表现者治疗见肾病综合征章节。
3、与慢性肾小球肾炎表现相同者，按慢性肾小球肾炎处理。
4、病理检查以新月体形成并伴IgA沉积为主者，可用强化血浆置换疗法及药物治疗（参见急进性肾小球肾炎治疗）。
三、血液净化疗法
伴有急性肾功衰竭时或已形成慢性肾功能衰竭者需进行血液透析或腹膜透析治疗。