肠道病毒71型为耐热、耐酸的微小RNA病毒，对乳鼠有致病力，引起类似柯萨奇A组病毒所引起的肌炎。在恒河猴中经口或注射感染能产生类似脊髓灰质炎的疾病。在猴子中的神经毒力似与该病毒在高温中的复制能力有关，但寡核苷酸电泳和凝胶电泳分离病毒蛋白后却未能区分无神经毒力株。
肠道病毒71型感染可出现各个系统的并发症，例如出现流行性肌痛疱疹性咽峡炎婴儿急性心肌炎无菌性脑膜炎，急性流行性眼结膜炎等并发症并由此进入血循环导致病毒血症(第一次病毒血症)，病毒可随血流带至全身各器官如中枢神经系统皮肤粘膜心脏，呼吸器官肝胰肌肉等处在该处进一步繁殖，引起病变并再次进入血环引起病毒血症。
肠道病毒71型可引起多种临床表现，在澳大利亚，瑞典和日本，主要表现为手，足，口腔病，通常发生于1～3天的前驱性发热之后，未观察到严重的中枢神经系统疾病，而1975年在保加利亚发生的肠道病毒71型流行中，则以无菌性脑膜炎为主，21％病例表现为类似于脊髓灰质炎的急性瘫痪，病情发展迅速，起病后10～30h即出现瘫痪，约半数病例表现为脑炎或脑神经损害(延髓性麻痹)，确诊病例的总病死率为6.2％，其中29.5％为瘫痪性疾病，65％为延髓性麻痹。
在美国的罗彻斯特，纽约和日本，香港发生的小规模流行暴发中均观察到手，足，口腔病与严重中枢神经系统感染可发生于肠道病毒71型的同一次流行之中。
其他较少见的临床表现包括：全身性斑丘疹，心肌炎，传染性多神经炎和上呼吸道炎，曾有1例新生儿疾病具有肠道病毒71型的血清学证据的报道。
肠道病毒71型感染的预防主要是日常生活中，要养成良好的习惯，注意卫生，杜绝传染源教育孩童、学生自幼养成卫生习惯，改掉吮手指的习惯，远离垃圾及不洁环境;养成游戏后、饭前、便后一定彻底洗手的习惯大人感染后没有症状，成为隐性传染源，更危险因为此病毒一般来说并不没特殊的治疗药物，而且还会并发其它症状特别是肠病毒流行高峰期(6～9月)，家长更要多多注意，防治肠病毒必须由个人卫生及环境卫生着手，除了要养成良好的生活习惯，经常正确洗手，注意饮食及饮水必须煮熟及煮沸其他的预防办法如下：
1、保证公共场所的卫生条件符合要求
对幼托机构的环境及玩具、公共游泳池等必须严格消毒
2、防止病毒通过口传染
儿童和成人都可能感染，因为此病毒是通过唾液、疱疹液、粪便污染的食物和物品密切接触传播
3、隔离患者
一发现有此病的症状，例如发现手足口征候的孩子，应将其与其他孩子隔离，且用具、玩具等要分开，马上送医院隔离治疗
4、健全疫情报告制度
凡出现发热、感冒或呼吸道症状，或发现手足口疱疹皮疹病儿，应速去医院就诊
5、提高人体免疫力，抵抗病毒
提高提高人体免疫力和做好预防措施一样重要，这是比较根本的措施日常生活中多吃些水果
肠道病毒71型可从多种临床标本中分离出来，包括疱疹液，粪便，口咽分泌物，尿和脑脊液，其中以疱疹液的分离率最高，脑脊液的分离率最低，分离培养阳性率以非洲绿猴肾细胞和乳鼠接种为最高，尽管在最适宜条件下，细胞病变也要到第5～8天才能观察到，血清特异性抗体检测有助于诊断。
严重脑神经损害患者，可出现脑电图异常。
肠道病毒71型感染患者在饮食上无特殊禁忌，主要是注意用餐卫生，饭前要洗手。患者的饮食以清淡、易消化为主，多吃蔬果，合理搭配膳食，注意营养充足。此外，患者还需注意忌辛辣、油腻、生冷的食物。
EV71感染目前缺乏特异高效的抗病毒药物，临床上以对症支持治疗为主。绝大多数患者为轻症，自然病程约为1周，预后较好，仅需对症治疗。但对于重症患者，需早期识别，积极救治。