分离性身份障碍是多种因素相互作用的结果：强烈的应激，能力的分离(包括在意识中将个人的记忆，知觉和身份统一)，成长过程中防御能力的习得，童年期遭受伤害后缺乏同情和抚慰以及对今后伤害性刺激的自我保护的能力缺乏等。身份认同的统一并不是与生俱来，它依赖于后天各种资源和经验而发展。在遭受创伤的孩童，这种发育被阻断，许多本该组合于同一身份中的特质仍然处于孤立状态。北美地区的研究显示，97％~98％分离性障碍成年病人报告童年虐待史，同时在85％的成年病人和95％的儿童，青少年分离性障碍以及其他形式相近的分离性障碍病人身上，可以验证有虐待史。虽然这些资料表明在北美地区病人中，童年虐待史是发病的重要因素(在有些文化背景中，战争和灾难起着更主要的作用)，但是这并不说明所有的病人都有虐待史，或者病人所报告的虐待经历确实发生过。有些虐待经历的描述被证明是不准确的。同时，有些没有虐待史的病人在童年早期却遭受过重大创伤(如父母亡故)，患过严重的疾病，或经历过重大的应激事件。举个例子，一个童年时代多次住院和手术的分离性障碍病人，他有着明确的创伤史，但没有虐待史。
个体的发展有赖于儿童时期将各种复杂的信息和经验成功地整合。当儿童获得对自己和周围人统一而复杂的认识后，他们将顺利渡过那些不同的知觉和情感分离的阶段。每个发育时期都产生有不同自我，同时并不是每个经受童年虐待和创伤的人都发展成多重人格。多重人格病人容易被催眠，而这一特质与分离性素质密切相联，同时它被认为是分离性障碍的患病因素之一。当然，绝大多数具有这些特质的儿童还是具有正常的适应能力，并且能够在成人的保护和抚慰下，不会发展成分离性身份障碍。
性身份障碍男孩表现女性化：喜欢着女孩装，喜欢和女孩一起玩耍，讨厌自己的生殖器官，安静少动，喜欢玩“过家家”游戏。女孩表现男性化：衣着朴素，做事干脆利落、风风火火，喜欢和男孩一起玩耍、打仗，举止粗犷，缺乏细腻的情感，勇敢好斗。本病一般无其他并发症。
男孩表现女性化：喜欢着女孩装，喜欢和女孩一起玩耍，讨厌自己的生殖器官，安静少动，喜欢玩“过家家”游戏。
女孩表现男性化：衣着朴素，做事干脆利落、风风火火，喜欢和男孩一起玩耍、打仗，举止粗犷，缺乏细腻的情感，勇敢好斗。
分离性身份障碍需要心理治疗，并可通过催眠术来强化心理治疗症状往往可以自发产生亦可自行消失，但疾病本身不会自行消失药物可以缓解症状，但对整个疾病疗效不明显通常情况下，每周两次以上心理治疗，并持续至少3～6年是非常重要的
性身份障碍患者的饮食以清淡、易消化为主，多吃蔬果，合理搭配膳食，注意营养充足。此外，患者还需注意忌辛辣、油腻、生冷的食物。
分离性身份障碍的症状可能有变化或减轻，但疾病本身不会自发缓解。药物会有助于缓解某些症状，但对疾病本质不起作用。所有成功的治疗都是使用针对分离性身份障碍的特殊心理治疗，促成病人人格的整合。有些病人不愿意或拒绝人格整合，对于他们，治疗目标应放在促成病人各种人格间的协调性和合作性上，以减轻症状。这种治疗十分艰巨和痛苦，各种人格间的相互作用暴露出病人所面临的危机，而病人对创伤性的记忆会感到痛苦。一次或多次住院可以帮助病人渡过困难时期，或者渡过其痛苦回忆时期。催眠可以用来了解各种人格特征，促成彼此间的沟通，使得它们协调平稳。催眠也用来发掘创伤性经验，减轻它们的消极影响。有时眼球运动失感觉和重新恢复试验(EMDR)是一种有效的方法，他使病人回忆起创伤性经验，并将对自我的负性思维替代为积极的思维。
如果要达到将病人的人格整合，促成其和谐统一，恢复正常功能，完全消除症状的治疗目标，一般需要每周至少两次，持续3~6年的心理治疗。而人格整合是最为理想的治疗结果。
心理治疗有三个主要阶段。第一阶段是加强安全感，稳定感，使病人足够坚强，面对创伤性经验和人格问题。对人格系统的发掘是为了计划以后进一步治疗。第二阶段，帮助病人回忆痛苦的经历，将对丧失和创伤的痛苦体验表达出来。当病人分离性症状原因被解除后，治疗进入最后阶段。这时对病人的自我，人际关系和社会功能进行连接，整合和修复。有些整合可以自发实现，但大多数需要对人格进行重新组合和构筑，或者必须借助想象和催眠促成。整合完成后，病人还必须对其余留进行治疗。整合后的治疗十分必要，治疗次数虽有所减少，但不能完全停止。病人会将精神科医生看做能帮助他们解决心理问题的人，一如他们定期寻求内科医生的帮助一样。