假膜性肠炎是由两种菌群产生毒素致病。
1.难辨梭状芽孢杆菌
是与抗生素相关的假膜性肠炎的重要发病原因。1935年由Hall等首先从婴儿的粪便中分离出来的细长的严格厌氧的革兰阳性杆菌。这种细菌是体内常驻细菌，存在于正常人的肠道中。在未接受抗生素治疗的患者中，难辨性梭状芽孢杆菌数量仅占厌氧菌的2%～3%，细菌产生的毒素少，甚至不产生对人体致病的毒素。
2.凝固酶阳性的溶血性耐药金黄色葡萄球菌
当使用大量广谱抗生素后（如土霉素、氯霉素、四环素、氨苄青霉素、先锋霉素等），抑制了肠道内包括大肠杆菌在内的各种菌群，耐药的金黄色葡萄球菌则大量繁殖产生外毒素，导致假膜性肠炎的发生。把这类病人的粪便涂片做革兰染色可找到成堆的球菌，如将这种细菌产生的毒素给动物注射也可以发生假膜性肠炎。
正常情况下胃肠道是一个平衡的生态系统，肠道内存在着大量的细菌，这些细菌菌种和数量基本上是恒定的。这些细菌有助于细菌本身和它所引起人体产生的抗体来抵抗感染。一旦某些因素使这个系统失去生态平衡，就会致病。抗生素最易产生菌群的比例失调，因此是假膜性肠炎发病的重要原因之一。最常引起假膜性肠炎的抗生素依次是氨苄青霉素、氯林可霉素和头孢菌素类。不常引起的是青霉素、红霉素和复方新诺明。偶可引起的是氯霉素、四环素、甲硝唑和氨基糖苷类药物。癌症和手术是重要的易感因素。
重症可并发不可逆性休克，迅速脱水，酸中毒；或并发急腹症伴中毒性巨结肠，结肠穿孔或腹膜炎，也可并发急性肠梗阻；可并发低蛋白血症，多发性关节炎等。
1、无症状感染型
大部分患儿为无症状感染型，但他们是重要的传染源。
2、单纯腹泻型
患儿无全身症状，主要表现为稀便，3～4次/d，为黏液水样便，大便可有白细胞，潜血试验阳性，乙状结肠镜检查可见肠黏膜轻度水肿，充血，无假膜，在停用广谱抗生素后不久，症状即可消失，无需特殊处理。
3、假膜性肠炎型
腹泻较重，每天10余次，大便呈蛋花汤样，有假膜及血便，患儿除表现腹泻外常有全身症状，表现为发热，腹痛，恶心，厌食，腹痛常于腹泻后缓解，病情重者可表现为脱水，外周血白细胞升高，大便中有大量白细胞，乙状结肠镜检查可见病变结肠与直肠黏膜上有大量散在的，斑块状黄色凸起的假膜，直径2～10mm，称为假膜性结节。
4、暴发型结肠炎型
腹泻每天可多达20余次，量多，奇臭，常有血便，假膜呈大片或管状，伴有发热，腹痛，腹胀，呕吐；危重者可高热，精神萎靡，面色苍白，甚至并发急性，肾功能衰竭，休克，DIC，肠穿孔等，此型预后较差，对这一型患儿应尽量避免结肠镜检查，以免引起肠穿孔，大手术。
本病预后往往相当严重，临床工作中应尽可能防止本病的发生，首先应注意抗生素的使用，避免滥用抗生素减少假膜性肠炎的发病率，尤其是广谱抗生素的使用要有明确的目的，在取得预期的疗效之后应及时停药，要经常向医务人员介绍有关假膜性肠炎的发病动态，防止耐药菌株的滋长，外源性难辨梭状芽孢杆菌可能是医院内的交叉感染，有人从医院的地板，盥洗室的用具，以及护理假膜性肠炎病人的工作人员的手和粪便中检出难辨梭状芽孢杆菌或其芽孢，所以对假膜性肠炎病例要采取必要的隔离措施和环境消毒，防止通过房间，皮肤，医疗器械造成难辨性梭状芽孢杆菌的交叉感染
一、实验室检查
1、粪便常规：将粪便涂片镜检，若发现革兰阳性杆菌及其芽孢将对临床判断很有帮助，随后可进行分阶段细菌培养，检查有无大量革兰阳性菌。
2、细菌学检查：90％的病例在发病时粪便中可培养到难辨梭状芽孢杆菌，送检时为了减少与空气的接触，必须采取至少多于容器容量的新鲜粪便，连同容器送检验，取CCFA专用培养基（由环丝氨酸，噻吩甲氧头孢霉素，果糖和蛋白质琼脂组成）接种，在厌氧条件下有选择性的分离难辨梭状芽孢杆菌，若菌落呈扁平，边缘不规则，粗糙状，革兰染色为阳性杆菌即可作出诊断。
3、细胞毒素的毒性实验：稀释的大便或细菌培养滤液，对组织培养细胞（HELA）有特异性的细胞病理效应，这种效应可被污泥梭状芽孢杆菌的抗毒素中和，从而证实难辨芽孢杆菌为产毒菌株。
4、毒素A的检测：可以用对流免疫电泳，酶联免疫吸附实验，乳胶凝集实验，单克隆抗体方法等检查毒素A。
二、影像学检查
1、结肠镜检：假膜性肠炎同时侵犯结肠，尤其是乙状结肠可借助结肠镜进行检查，国内有报道应用纤维结肠镜检查了16例假膜性肠炎的患者，其中有14例在直肠和乙状结肠部位发现了病变，典型的表现为黏膜发红水肿，上面有斑块或融合的假膜，活检可见黏膜有急性炎症，假膜内含有坏死上皮，纤维蛋白，炎性细菌等，应用纤维结肠镜检查时要掌握病程进展的阶段，肠炎尚未形成假膜或局部的假膜已经脱落时镜下未必能发现假膜，所以不一定以假膜为唯一的诊断根据，未见假膜并不一定能排除本病，假膜性肠炎病变可以呈跳跃式分布，为了防止遗漏小的病变，要求镜检的范围必须包括全结肠，在有代表性部位采取病变组织，采取活检时要有一定的深度。
2、腹部X线平片：常有肠黏膜增厚，小肠胀气，部分肠麻痹病人表现为肠梗阻，钡灌肠可能发现肠管边呈毛刷状，指压迹症和散在的圆形，不规则形充盈缺损，气钡双重造影可提供更多的诊断指标，但必须小心操作防止肠穿孔的发生。
3、超声诊断：超声能发现局部肠壁假膜，黏膜及黏膜下水肿导致的重度增厚，肠腔变窄或消失，仔细探查可于右下腹发现似肠结核或肿瘤的假肾征，条件好的超声诊断仪还能更准确地分辨病变相关的层次，除此之外，超声诊断能发现疾病伴发的腹水等。
4、CT诊断：CT的表现不具有特异性，偶可发现低衰减的增厚的肠壁。
假膜性肠炎患儿饮食建议包括以下几条：1、多以清淡食物为主，注意饮食规律。多吃水果，少吃油腻的食物。 2、根据医生的建议合理饮食。
一、治疗
1、停用抗生素一旦诊断明确，立即停用原用的抗生素，最常见的为氨苄西林（氨基苄青霉素）、青霉素、头孢菌素、林可霉素（洁霉素）等。轻型病人停药后48h，症状明显好转，7～10天治愈。严重病例需时较长。
2、单纯性腹泻患儿对单纯性腹泻患儿，无需特殊治疗，或应用调节肠道微生态药物，如双歧杆菌、乳酸杆菌制剂，使肠道内正常菌群生长即可控制临床症状。不能口服者经胃管给予或灌肠亦可达到治疗目的。对腹泻严重的患儿应注意水和电解质的平衡，需要时予以及时补液治疗。
3、抗生素治疗一般在病情较重或停用原先使用抗生素48h病情无好转者，才改用其他抗生素治疗。宜口服在肠道不易吸收的且不易诱发梭状芽孢杆菌肠炎的抗生素，应用剂量要大，疗程要长，才能达到清除病原菌，防止复发的目的。针对致病菌适当口服或静脉注射抗生素。治疗中，禁用抗肠蠕动药物，因其抑制肠蠕动可增加肠道中杆菌和毒素的停留吸收，使用这类药物还可诱发中毒性巨结肠。
（1）万古毒素：万古霉素在治疗难辨梭状芽孢杆菌的效果可达100％，剂量为40mg/kg，分3次服，疗程为7～10天，一般用药2～4天症状即可消失。
（2）甲硝唑（灭滴灵）：每天20mg/kg，分3次服，疗程7～10天，也可同时选用万古毒素。
（3）利福平：每天10～15mg/kg，分3次口服，疗程1～2周。危重病儿有中毒性肠麻痹、肠穿孔不能口服时，可选用上述药物交替静脉点滴，但任何一种药物单独静脉点滴时，均不能使结肠内药物达到足以清除病菌的浓度，一旦病情好转，应立即改为口服。
（4）复发时的治疗：难辨梭状芽孢杆菌感染首次复发时症状较轻者可不用药物治疗，症状严重者应继续给予甲硝唑或万古霉素治疗，但疗程应延长至14天。
（5）口服考来烯胺（消胆胺）：口服考来烯胺（消胆胺）在肠道内发挥离子交换作用，能吸附肠腔内梭状芽孢杆产生的菌毒素后排出。患儿在口服万古霉素的同时可以加用考来烯胺（消胆胺），每天分2次口服。但它也能吸附万古霉素，因此，这两种药物应相隔3h分别服用。也可口服促肠道菌群恢复的药物，如口服双歧杆菌三联活菌制剂（培菲康）、双歧杆菌（丽珠肠乐）等活菌制剂。
4、其他治疗矫正脱水酸中毒、输血、人血白蛋白及肾上腺皮质激素。由难辨梭状芽孢杆菌免疫牛后获得的牛乳也可用于中和肠腔内毒素。应用抗难辨梭状芽孢杆菌抗血清治疗也有效。对顽固性难辨梭状芽孢杆菌性肠炎可试用静脉注射免疫球蛋白，以中和患儿血液中的细菌毒素。
5、治疗并发症并发肠穿孔时应及时转外科治疗。合并肾衰、休克、DIC时应及时给予相应的急救处理。
二、预后
立即停用原用的抗生素，轻型病人停药后48h，症状明显好转，本病经1～2周正规治疗，80％～90％可痊愈，严重病例需时较长。少数在停药1～2周可复发，或病程迁延可达1～4个月，重新选用以上药物治疗，仍可达到治愈目的。但延误治疗及暴发型预后较差。