1、这要从胚胎的发育说起。胚胎早期，胎儿的肛门和直肠没有分开，直肠和膀胱又连通在一起，共同形成了一个腔，叫泄殖腔。当胚胎发育到第七周时，中胚层向下生长，将直肠与尿生殖窦分开，直肠向会阴部发展，尿生殖窦则形成膀胱、尿道或阴道。到第九周时，直肠向下伸延，穿通骨盆膜和肛门膜与原始肛门相连通，形成直肠肛门。在这个时期因某些原因，骨盆膈膜或肛门膈膜不能被直肠穿通，就形成了肛门先天性闭锁症，这样的婴儿就没有肛门，通常称之为锁肛。
2、先天性肛门闭锁症是常见的肛门畸形疾病。
3、若直肠与尿生殖窦没有分开，则会形成先天性直肠尿道瘘或直肠阴道瘘。而锁肛症常合并直肠尿道瘘、直肠阴道瘘。
4、目前来说，致病原因不详。发生概率为1/4000。
患儿可能并发有直肠尿道瘘、直肠阴道瘘，大便则会从尿道或阴道排出，此类新生儿不会导致死亡。但若粪便的异常排泄没有被注意，尿道或阴道存留粪便过多，可引起膀胱炎、肾盂肾炎、阴道炎等。
1、本病主要表现为婴儿出生后无胎粪排出，哭闹不安，腹胀、呕吐，不见肛门。一些患儿同时合并有直肠尿道瘘和直肠阴道瘘，除以上症状外还出现胎粪由尿道或阴道排出，尿液混浊。
2、对本病的诊断，主要根据患儿哭时随着腹压的增高或降低，会阴部也随着凸起或凹陷。用一手轻压迫下腹部，一手触摸会阴部，则有波动感。若将患儿臀部抬高，肛门部扣诊呈鼓音。X线可帮助进一步确诊。
3、先天性肛门闭锁新生儿出生后无胎粪排出，喂奶后腹部膨胀，出现呕吐，继尔皮肤干瘪、消瘦，若出现这种症状，即应考虑锁肛症，若发现和治疗不及时，则易导致肠梗阻，肠坏死，致新生儿死亡。
4、若患儿并发有直肠尿道瘘、直肠阴道瘘，大便则会从尿道或阴道排出，此类新生儿不会导致死亡。但若粪便的异常排泄没有被注意，尿道或阴道存留粪便过多，可引起膀胱炎、肾盂肾炎、阴道炎等。
5、若患儿是先天性肛门直肠狭窄，则可表现为顽固性便秘，排便疼痛，啼哭，便极细，量少，腹部胀痛，消化不良，消瘦。
6、新生儿的锁肛症，常常被忽视，因此，在新生儿出生后，要予以全面的体检，并注意观察排便情况，以防止发生新生儿死亡。
先天性肛门闭锁属于先天性疾病，发病原因不明，发病机制尚不明确，目前尚无有效的预防措施早期发现早期诊断早期治疗，防止并发症的发生
本病主要表现为婴儿出生后无胎粪排出，哭闹不安，腹胀、呕吐，不见肛门。一些患儿同时合并有直肠尿道瘘和直肠阴道瘘，除以上症状外还出现胎粪由尿道或阴道排出，尿液混浊。同时结合以下检查结果进行诊断。
1、直肠指诊。
2、超声波。
3、穿刺。
一、宜手术早期禁食
1、宜吃流质或者软食。
2、宜吃胶原蛋白丰富的食物。
二、忌吃发物的食物
1、忌吃辛辣刺激性的食物。
2、忌吃油腻的食物以及油炸食物。
1、本病的治疗主要是手术，如只有肛膜遮盖者，可行前后纵切口或十字切开，将薄膜剪去，再用食指伸入扩张；如有纤维带者，可将其纤维带切除；如肛膜较厚者，可切开皮肤和直肠，将直肠粘膜下牵，与皮肤缝合。术后扩肛，每周2～3次，直至肛门无狭窄为止。
2、由于肛门闭锁是先天直肠肛门发育不良造成的，出生后通过手术人造肛门，其局部的肛门括约肌不会象正常人那样健全，或是括约肌薄弱无力，或是括约肌缺失。所以，术后大多数孩子在有肛门狭窄的同时，又伴大便失禁，尤其是稀便控制不住，经常有粪便污染内裤。另外，由于手术时将直肠粘膜直接与肛门皮肤缝合，而没有一段“肛管”，所以还常伴有肠粘膜外翻，外翻的肠粘膜受到摩擦和粪便污染后会出现炎症反应，可有粘液血便，肛周皮肤出现湿疹等现象。因此，这类孩子在生活护理上一定要勤洗勤换，积极治疗其并发症。对先天性肛门闭锁的治疗，均以为主。
3、二是先在腹部作一个人工肛门，等小儿长到1～2岁，再作切开腹部或骶尾部的直肠肛门吻合术。
4、三是用自动间歇电磁吸引治疗锁肛。即作乙状结肠造瘘（即人工肛门）后，把适当的圆柱状铁块（直径在约0。5cm）送入直肠盲段，然后用间歇性磁力吸引装置在体外肛门部位进行吸引，使直肠由高位逐渐下降到低位时，再作低位切开肛门成形术。该方法创伤小，并发症少，肛门失禁等后遗症较少。
5、只要治疗及时、得法，锁肛症一般不会导致新生儿死亡。