肝胆管结石的发病原因与胆道的细菌感染、寄生虫感染及胆汁滞留有关。此外，胆汁中的黏蛋白、酸性黏多糖、免疫球蛋白等大分子物质，炎性渗出物，以及脱落的上皮细胞、细菌、寄生虫、胆汁中的金属离子等，均参与结石的形成。
肝内胆管结石的发病原因与胆道的细菌感染、寄生虫感染及胆汁滞留有关。本病可能会并发胆汁性肝硬化、肝萎缩、肝脓肿等。
肝胆管结石病根据病程及病理的不同，其临床表现可以是多方面的，具体表现如下。
1、上腹部疼痛，可能为典型胆绞痛或持续性胀痛，有的患者疼痛不明显，而寒战发热非常明显，周期发作。
2、可有长期的胆道病史或伴有寒战发热、黄疸的急性胆管炎史。
3、患侧肝区及下胸部有经常性疼痛不适，常放射至背、肩部。一侧肝管梗阻时，可无黄疸或黄疸甚轻。
4、急性期可出现急性化脓性胆管炎的症状或不同程度的Charcot三联征（疼痛、寒战发热、黄疸），多数可能是合并的肝外胆管结石所致。
5、肝区压痛和叩击痛明显，肝脏呈不对称性肿大并有压痛。
肝胆管结石的产生是因为胆汁的成石性，但关键还在于胆汁引流的通畅性，因此，平时要规律饮食，定期复查B超，了解肝内外胆道的代偿性扩张变化情况，必要时可以吃一些利胆剂，促进胆汁的排泄这些可能会对您的预防有所帮助部分胆囊切除术后胆总管再长结石是因为胆总管下端乳头括约肌功能异常，或者胆囊结石有一些小的颗粒掉入胆总管，没有症状，而随着时间而进行性长大，才被发现不要紧张这些石头即使出现，以后只要早期发现，通过内镜就可以取出了
肝胆管结石的诊断，除了在临床上提高对本病的认识外，确诊主要依靠影像学检查。本病的临床检查具体如下。
一、影像学检查
1、B超检查
为无创性检查，方便易行，是肝内胆管结石诊断的首选方法。一般在结石远端的胆管有扩张才能作出肝内胆管结石的诊断，因肝内管道系统的钙化也具有结石样的影像表现。
2、CT或MRCP检查
因肝胆管结石主要是含胆红素钙的色素性结石，钙的含量较高，故在CT照片能清楚地显示出来。CT还能显示出肝门的位置、胆管扩张及肝脏肥大、萎缩的变化，系统地观察各个层面，可以了解结石在肝内胆管分布的情况。胆管系统内的胆汁属于相对静止的液体，MRCP可清晰显示胆管系统的形态结构。
3、X线胆道造影
是用于肝内胆管结石诊断的经典方法，一般均能作出正确的诊断。X线胆道造影应满足诊断和手术的需要，一个良好的胆道造影片应能够全面了解肝内胆管系统的解剖学变异和结石的分布范围。
二、其他辅助检查
1、胆道测压
通过胆道测压可以了解胆汁通过胆道排泄是否正常。对于某一分支肝内胆管结石，胆道测压的临床意义不大。但对左右肝管接近肝门部位的结石伴胆管狭窄，可发现胆汁排泄不良，在病变上方引起胆管扩张、胆汁潴留、胆道压力增高。现在已有电子胆道测压仪精确的测量胆管内的压力，应根据病情选择使用。
2、核素扫描
常用核素99mTe，静脉注入后经网状内皮系统摄取后，排泄入胆道。扫描时可分层、定点，获得三维图像，显示与邻近结构的关系，对诊断提供较好的依据。但对肝内胆管结石的诊断不理想。
3、选择性腹腔动脉造影
观察动脉血管是否存在移位、受压、中断及异常血管影。对于鉴别诊断肝胆管癌、胆囊癌效果好，但对肝内胆管结石的诊断不理想。而且动脉造影要求一定的设备，操作繁琐，技术条件要求高，不作为肝内胆管结石的首选方法。
肝胆管结石患者宜食粗粮、新鲜蔬菜、大蒜、洋葱、香菇、木耳等。患者应食用含维生素A或维生素K丰富的蔬菜。患者还要注意忌高脂肪食物，如猪油、油炸食品，油多的糕点也不宜多吃，忌食辛辣刺激的调味品。
肝胆管结石可以通过微创保肝取石术进行治疗。微创保肝取石是在ERCP内镜基础上，采用十二指肠大乳头球囊扩张胆管出口，将ERCP内镜送入胆总管内，通过胆总管直达肝内胆管，通过肝内胆管球囊扩张肝内胆管，扩开肝内胆管内径，通畅取石通道，可以一次性彻底清除肝内胆管结石，手术全程在视频可视下内镜操作，无痛、无创伤、无出血，一次彻底治愈肝内胆管结石，保住正常的肝脏组织。
手术的方法主要有高位胆管切开取石，胆肠内引流，消除肝内感染性病灶。一旦患者在术后经T管造影被发现有胆道残留结石时，可在窦道形成后拔除T管，经窦道插入胆道镜，在直视下用取石钳、网篮等取石。如结石过大可采用激光碎石、微爆破碎石或其他方法将残石碎裂成小块后再取出。