本病的病因机制尚不清楚。文献报道与睡眠障碍、神经递质分泌异常及免疫紊乱有关。睡眠障碍、神经递质分泌异常及免疫紊乱详细介绍如下：
1、睡眠障碍
睡眠障碍累及60—90％的病人。表现为睡眠易醒、多梦、晨起精神不振、疲乏、有全身疼痛和晨僵感。夜间脑电图记录发现有α波介入到Ⅳ期δ睡眠波中。用铃声干扰志愿者非快动眼睡眠(nonrapideyemovement)亦可诱导出上述脑电图图形及临床症状。其他影响睡眠的因素如精神紧张、环境噪音均可加重纤维肌痛综合症症状。因此推测，这种Ⅳ期睡眠异常在纤维肌痛综合征的发开门见山中起重要作用。
2、神经递质分泌异常
文献报道血清素(serotonin，5-HT)和P物质(substanceP)等神经递质在本病的发病中起重要作用。
血清素的前体是色氨酸、食物蛋白中的色氨酸在肠道被吸收后，大部分与血浆蛋白结合，小部分呈游离状态。游离的色氨酸可被载体携带通过血-脑屏障进入脑组织。然后，在5-HT能神经元中经羟化和脱羧作用生成5-HT。释放到突触间隙的5-HT，在部分被突触前神经末梢重摄取，部分经线粒体单胺氧化酶作用生成无活性的5-羟吲哚乙酸(5-hydroxyindoleaceticacid)。5-HT也存在于消化道粘膜、血小板及乳腺细胞中，由于它很难通过血-脑屏障，所以中枢神经系统与外周血中的5-HT分属两个系统。
另一种与纤维肌痛综合征有关的神经递质是P物质。Littlejohn发现，物理或化学刺激可诱导纤维肌痛综合征病人产生明显的皮肤充血反应，这种过度反应可能与存在着持续的末梢伤害刺激有关。由于这些刺激，皮肤多型伤害感受器(polymodalcutaneousnociceptor)反射性地从神经末梢释放病理量的P物质，后者又可引起局部血管扩张，血管通透性增强及一种神经源性炎症(neurogenicinflammmation)。神经末梢释放P物质后，背根神经节的初级感觉神经无将合成更多的P物质，以便维持一个恒定水平。合成的P物质同时向末梢和中枢？虼？荩？虼酥惺嗌窬？低车男物质含量增高。由于它的缓慢但持久而强烈的兴奋作用，中枢神经系统必会受到一定影响。
此外还发现在正常或高水平的5-HT存在下，P物质对感觉神经冲动的发放有一个阻尼作用。缺乏5-HT，它将失去这种控制作用，导致痛觉过敏。
3、免疫紊乱
一些作者报道在纤维肌痛综合征病人的真皮-表皮交界处有免疫反应物沉积，用电子显微镜观察发现纤维肌痛综合病人肌肉毛细血管内皮细胞肿胀，提示有急性血管损伤；组织缺氧及通透性增强。病人常述的原因不明的体重增加，手弥漫性肿胀及夜尿增多可能与通透性增强有关。
此外，初步研究发现，白介素-2(interleukin-2，IL-2)水平在纤维肌痛综合征中升高。接受IL-2治疗的肿瘤病人会出生纤维肌痛综合征样症状，包括广泛的疼痛、睡眠障碍、晨僵及出现压痛点等。还发现α干扰素可引起疲乏。上述现象提示免疫调节紊乱。体内细胞因子水平异常可能与纤维肌痛综合征的发开门见山有关。
纤维肌痛综合症最常见的发病年龄25—45岁，其临床表现多种多样的。该病是一种非关节性风湿病，其病理生理至今不明，可并发肠激惹综合征、头痛、抑郁和焦虑症等。
纤维肌痛综合征多见于女性，最常见的发病年龄25—45岁，其临床表现多种多样，但主要有下述4组症状：
1、主要症状：全身广泛疼痛是所有纤维肌痛综合征病人都具有症状。虽然有的病人仅主诉一处或几处疼痛，但1/4的病人疼痛部位可达24处以上，疾病遍布全身各处，尤以中轴骨骼(颈，胸椎，下背部)及肩胛带，骨盆带等处为常见，其他常见部位依次为膝、头、肘、踝、足、上背、中背、腕、臀部、大腿和小腿，大部分病人将这种疼痛描写为刺痛，痛得令人心烦意乱。
另一个所有病人都具有症状为广泛存在的压痛点，这些压痛点存在于肌腱，肌肉及其他组织中，往往呈对称性分布，在压痛点部位，病人与正常人对“按压”的反应不同，但在其他部位则无区别。
2、特征性疾病：这一组症状包括睡眠障碍、疲劳及晨僵。约90％的病人有睡眠障碍，表现为失眠、易醒、多梦、精神不振，夜间脑电图显示有α波介入到非快支眼节律中，提示缺乏熟睡。50—90％的病人有疲劳感，约一半病人疲劳症状较严重，以至于感到“太累，无法工作”。晨僵见于76—91％的病人，其严重程度与睡眠及疾病活动性有关。
3、常见症状：这一组症状中最常见的是麻木和肿胀，病人常诉关节、关节周围肿胀，但无客观体征，其次为头痛、肠激惹综合征。头痛可分偏头痛或非偏头痛性头痛，后者是一种在枕区或整个头部的压迫性钝痛。心理异常包括抑郁和焦虑也比较常见，此外病人劳动能力下降，约1/3的病人需改换工作，少部分人不能坚持日常工作。以上症状常因天气潮冷、精神紧张、过度劳累而加重，局部受热、精神放松、良好睡眠、适度活动可使症状减轻。
4、混合症状：原发性纤维肌痛综合征很少见，大部分纤维肌痛综合征病人都同时患有某种风湿病，这时临床症状即为两者症状的交织与重叠。纤维肌痛综合征常使与之共存在风湿病症状显得更严重，如不认识这种情况常会导致对后者的过度治疗和检查。
纤维肌痛综合征是一种特发性疾病，可继发于外伤，各种风湿病，可通过以下几种方法来进行预防：
1、居住的房屋应通风、向阳，保持室内空气新鲜，被褥干燥
2、洗漱宜用温水，晚间洗脚，热水应能浸泡及踝关节以上，时间在15分钟左右，以促进下肢血液通畅
3、预防感冒
4、保持良好的精神状态，切不可急躁焦虑，也不可满不在乎，更不能情绪低落
5、坚持锻炼身体，以增强体质，提高抗病能力
除非合并其他疾病，纤维肌前综合征一般无实验室异常，但有报道纤维肌痛综合征病人IL-1水平增高，自然杀伤细胞及血清素活性减低，脑脊液中P物质浓度升高，药1/3病人有雷诺现象，在这一组病人中可有抗核抗体阳性，C3水平减低。
自70年代Smythe首次提出纤维肌痛综合征诊断标准以来，相继以许多诊断标准问世，但这些标准在方法学上，内容上都不尽相同，从而给流行病学及临床研究带来一些困难，为此国外学者通过多中心协作，在以往标准的基础上，研究了大量病人的临床症状及压痛点，从中筛选出最有鉴别意义的一个临床症状及18个压痛点，提出了1990年纤维肌痛综合征的分类标准。
1、持续3个月以上的全身性疼痛：身体的左、右侧，腰的上、下部及中轴骨骼(颈椎或前胸或胸椎或下背部)等部位同时疼痛时才认为是全身性疼痛。
2、用拇指按压(按压力约为4kg)18个压痛点中至少有11个疼痛，这18个(9对)压痛点部位是：枕骨下肌肉附着处、斜方肌上缘中点、第5至第7颈椎横突间隙的前面、冈上肌起始部、肩胛棘上方近内侧缘、肱骨外上髁远端2cm处、第二肋骨与软骨交界处并恰在交界处外侧上缘、臀我上象限、臀前皱襞处、大粗隆后方、膝内侧脂肪垫关节折皱线的近侧，同时满意上述2个条件者，可诊为纤维肌痛综合征。
应用这个标准可使纤维肌痛综合征的定义更趋一致，该标准所强调的纤维肌痛综合征与其他类似疾病的区别处，因而没有包括综合征特征性表现，如疲劳、睡眠障碍、晨僵等。应用这个标准时，考虑到上述特点，将会增加诊断的可靠性，正确性，但这个标准不能区分原发性纤维肌痛综合征和继发性纤维肌痛综合征。因此，纤维肌痛综合征诊断成立后，还必须检查有无其他伴随疾病，以区分原发性与继发性纤维肌综合征，这种区分在临床研究及疗效观察显然是必要的。
无特殊饮食禁忌，平时饮食清淡富于营养，注意膳食平衡。忌辛辣刺激食物。以免造成病情反复的情况，比如说，海鲜、鸡肉、狗肉等。与此同时，也不要禁食刺激性的食物。多吃新鲜的蔬菜和水果。新鲜的蔬菜和水果含有大量人体所需的营养成分。多吃提高免疫力的食物，以提高机体抗病能力。推荐以下几个食疗方：
1、附子粥：准备好附子5g，干姜2.5g，大米90g，葱白2根，少量红糖，首先要把附子、干姜研为极细的粉末，然后取大米煮粥，等到煮沸以后，再调入药末、葱白和红糖，一同煮为稀粥。另有一种做法就是用附子、干姜水煎取其汁，再同大米、葱、糖煮粥服食。
2、薏仁山药猪肚汤：先洗干净一个猪肚，再把砂仁、薏仁和新鲜的山药一起放置在入猪肚里面，加水，用麻绳将猪肚口结扎封口，再放入锅内，加适量水煎制，等熟了之后将猪肚取出，去除里面的药渣，吃猪肚和山药，喝已经浸入药香的汤。
3、核桃葱姜茶：先准备好饱满的核桃仁、葱白、生姜各20g，茶叶15g。把核桃仁、葱白和生姜一起捣烂，同茶叶同时放在砂锅中，加一碗半水煎沸，之后去渣一次性服下，然后躺在床上用被子盖上避风捂汗，每天服用一次。
纤维肌痛综合征属中医痹病范畴。中医中药治疗施行安神养血、疏筋通络、活血化瘀、行气止痛，以解除患者的疼痛及睡眠障碍。
本病常有头痛失眠、心烦易怒、身痛无定处、两胁胀痛等肝郁气滞表现，选柴胡舒肝散加减或六郁丸方加减，常用中药：制香附、醋柴胡、杭白芍、全当归、延胡索、郁金、炒枳壳、川芎、苍术、栀子、合欢花、夜交藤、炒枣仁、炙甘草。若身痛如刺，固定不移，夜间痛重，舌质暗红有淤血或瘀斑等血淤证为主者可选用逐瘀汤或血府逐瘀汤加减，常用中药：丹参、赤芍、牛膝、地龙、羌活、秦艽、香附、桃仁、红花、炒灵脂、没药、延胡索、川楝子。